桂林市妇女儿童医院经桂林市人民政府批准于2006年2月由原桂林市第四人民医院（原地区人民医院）和原桂林市妇幼保健院合并组建而成。
原桂林市第四人民医院始建于1951年，1998年地市合并后由桂林地区人民医院更名为“桂林市第四人民医院”。2000年经上级批复增挂“桂林市红十字会博爱医院”。2001年通过“三级乙等”医院评审。
原桂林市妇幼保健院始建于1911年。前身为教会医院，以产科为主。1951年由桂林市人民政府接管，1994年增挂“桂林市妇女儿童医院”，同年获“爱婴医院”称号， 1998年通过“二级甲等”妇幼保健院评审。
桂林市妇女儿童医院现有职工1275人，开放床位650张。高级医技人员48人，中级医技人员496人，初级医技人员278人。
桂林市妇女儿童医院设有内科、外科、妇科、产科、小儿科、新生儿科、生殖中心、放射科、保健部等30多个临床、医技科室。开展的重点特色专科有妇科、产科、小儿科、新生儿科、生殖中心、骨外科、泌尿外科、神经外科、肿瘤科、消化内科、眼科等。2002年12月创建了桂林市较早老年康复治疗中心。
桂林市妇女儿童医院拥有先进的美国产双排螺旋CT机、胸腹腔镜前列腺电切镜电子成像系统、数字减影X线机、血液透析机、远程胎心监护系统、妊高症监护系统、宫腔镜、四维彩色B超、德国HATT高频热疗机等多种大型先进设备。生殖中心还拥有500多万元的先进仪器设备及三个实验室（遗传实验室、内分泌实验室及辅助生殖实验室）。
桂林市妇女儿童医院已开展了多项具有领先水平的新技术、新项目：
1、产科开展各种术式的剖宫产、全程陪伴分娩、远程胎心监护系统、产前筛查。
2、妇科开展新阴式子宫切除术、全无痛人流术、各种恶性肿瘤根治术。
3、生殖中心开展宫腔内人工授精、体外授精--胚胎移植（试管婴儿）、显微授精（第二代“试管婴儿”），填补了桂林市在这一领域的空白。
4、小儿内科在全市首先开设“地贫之家”，收治地中海贫血儿童。引进小儿支气管哮喘新疗法、小儿脑瘫康复训练和治疗。
5、新生儿科采取全封闭管理模式，对患儿进行24小时监护、治疗、喂养。曾成功抢救国内外罕见的早产极低体重双胞胎、四胞胎。
6、心血管内科率先在桂林市开展了二尖瓣球囊成形术及其它介入治疗。
7、骨科成功施行了全国首例小儿拇指旋转撕脱性离断再植术；开展了桂林市首例无柄髋关节人工置换术和经皮穿刺腰椎间盘切吸术。
8、颅脑外科在广西率先成功开展顽固性癫痫外科治疗手术。
9、泌尿外科在桂林市最早开展经尿道前列腺电切、膀胱肿瘤电切。
10、普外科率先在桂林市开展烧伤湿敷疗法。
11、肿瘤科开展了直肠癌双根治疗、肿瘤介入治疗和放射性粒子植入治疗恶性肿瘤等先进技术。
12、儿童保健科新开展儿童早教儿童感觉综合训练、新生儿听力筛查、新生儿婴儿智能游泳法、儿童血铅诊疗等项目。
13、妇女保健科：开展妇女“五期”保健，乳腺疾病防治，妇女病普查普治。
14、婚前保健：开展婚前医学检查、卫生指导、优生优育咨询等